An den vier Adventssonntagen war kein Orgeldienst zu absolvieren (264/213, 1161a/19).

Die Domorgel stammte ursprünglich aus Engelszell, wo sie 1764 Franz X. Chrismann erbaut hatte, und war zwischen 1788 und 1790 nach Linz übertragen und erweitert worden. Die von Bruckner angeregten Veränderungen wurden 1856 bis 1867 von Josef Breinbauer durchgeführt. Von diesem stammte auch die Kleinorgel (I/7) in der Aloisiuskapelle des Domes (1251/170f).